Komentarze można dodawać w dowolnym miejscu badanego tekstu, nie tylko przy fragmentach zidentyfikowanych jako podobne. Aby uruchomić moduł komentowania należy kliknąć ikonę "Dodaj komentarz" w menu po lewej stronie ekranu. Jeśli moduł komentarzy jest włączony przycisk jest podświetlony na szaro. W oknie dodawania komentarzy możliwe jest dodanie wyróżnienia zaznaczonego tekstu kolorem z palety. Okno umożliwia również formatowanie tekstu — na przykład przekreślenie go lub pogrubienie.
Utworzone komentarze są automatycznie dodawane w postaci listy do nowej sekcji "Lista komentarzy", która umożliwia łatwe wyszukiwanie ich w tekście. Dodane komentarze można także edytować i usuwać.
Obok opcji dodawania komentarzy znajduje się opcja „Włącz/wyłącz podświetlanie źródeł”, której celem jest poprawienie czytelności tekstu podczas pracy nad komentarzami. Chcąc skupić się na źródłach należy wyłączyć podświetlanie komentarzy.